पीत ज्वर का निदान सरल नहीं है, क्योंकि नैदानिक चित्र रोगसूचक विज्ञान के साथ अन्य वायरल रक्तस्रावी बुखार, मलेरिया, टाइफाइड बुखार, लेप्टोस्पायरोसिस, डेंगू और हेपेटाइटिस से अलग करने में मुश्किल पेश कर सकता है।
पीला बुखार, इसलिए, एक स्थानिक क्षेत्र के रोगियों में संदेह किया जाना चाहिए जो ब्रैडीकार्डिया और पीलिया के साथ अचानक बुखार विकसित करते हैं। एक योग्य अस्पताल में तुरंत किए गए प्रयोगशाला परीक्षण निदान की पुष्टि या बाहर करने की अनुमति देंगे।
इस उद्देश्य के लिए उपयोगी सर्वेक्षणों में पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन (आरटी-पीसीआर) के साथ रक्त गणना, मूत्रालय, यकृत समारोह परीक्षण, सेल संस्कृतियों और रेट्रो-ट्रांसक्रिप्शन शामिल हैं। नैदानिक परीक्षणों को सीरोलॉजिकल परीक्षणों द्वारा ज्ञात विशिष्ट एंटीबॉडी की उपस्थिति से प्रदान किया जाता है, जैसे कि एलिसा (एंजाइम-लिंक्ड इम्यूनोसॉर्बेंट परख)।
