क्योंकि एंटीबायोटिक्स केवल बैक्टीरिया के संक्रमण के खिलाफ प्रभावी होते हैं, और क्योंकि इन्फ्लूएंजा एक वायरस के कारण होता है, इन दवाओं के उपयोग से इन्फ्लूएंजा के इलाज में कोई लाभ नहीं मिलता है ।
इतना ही नहीं। कुछ मामलों में, गलत कारणों के लिए एंटीबायोटिक्स लेने से भी महत्वपूर्ण दुष्प्रभाव हो सकते हैं: सबसे पहले, क्योंकि यह अच्छे जीवाणुओं (कॉमन्सल्स और सिम्बायोटिक्स) को मारता है जो आंत को आबाद करते हैं, जिससे कई मामलों में दस्त होते हैं; दूसरी बात यह है कि यह एंटीबायोटिक दवाओं के लिए प्रतिरोधी बैक्टीरिया के चयन का पक्षधर है।
इसका मतलब है कि ये सूक्ष्मजीव दवा की कार्रवाई का विरोध करने की क्षमता "विकसित" करते हैं; इस प्रकार उस एंटीबायोटिक्स का उपयोग जरूरत के समय में सही काम नहीं कर सकता है। यह जोखिम न केवल व्यक्ति को, बल्कि अन्य लोगों को भी प्रभावित करता है जो बाद में इन प्रतिरोधी बैक्टीरिया से संक्रमित होंगे।
फिर भी इन्फ्लूएंजा के मामले हैं जिनमें एंटीबायोटिक का सेवन आवश्यक हो जाता है ।
उदाहरण के लिए, स्पैनिश इन्फ्लूएंजा (1918-1920, दुनिया भर में 75 मिलियन पीड़ित) की महामारी के दौरान, बैक्टीरियल जटिलताओं के उपचार के लिए एंटीबायोटिक दवाओं की अनुपस्थिति से सबसे अधिक मौतें हुईं। विचार करें, वास्तव में, एक जीव जो इन्फ्लूएंजा वायरस द्वारा दृढ़ता से कमजोर होता है, वह बैक्टीरिया के हमले से अधिक उजागर होता है; आश्चर्य की बात नहीं, डॉक्टर बैक्टीरियल अति-संक्रमण के बारे में बात करते हैं। एक उदाहरण देने के लिए, फ्लू और ठंड के वायरस वायुमार्ग के श्लेष्म झिल्ली को नुकसान पहुंचाते हैं और जीवंत पलकों को लकवा मारते हैं; इस तरह वे जीवाणु न्यूमोनिया के लिए जिम्मेदार रोगाणुओं के प्रवेश का मार्ग प्रशस्त करते हैं।
फ्लू की जटिलताओं के मामले में, इसलिए, एंटीबायोटिक दवाओं का उपयोग मौलिक हो सकता है। इसलिए यह सलाह दी जाती है कि केवल एंटीबायोटिक्स लेने की सलाह दी जाए, अगर डॉक्टर द्वारा निर्धारित किया जाए, तो सावधानीपूर्वक उसके निर्देशों का पालन करें कि इसका उपयोग कैसे किया जाए।
