रोगजनन एक बीमारी के विकास और इसके साथ जुड़ी घटनाओं की श्रृंखला की जांच करता है, जो कदम से कदम प्रभावित अंगों से संबंधित कोशिकाओं और ऊतकों के मोर्फो-कार्यात्मक परिवर्तनों को निर्धारित करते हैं। ये परिवर्तन रासायनिक, भौतिक या जैविक एजेंटों (वायरस, बैक्टीरिया, आदि) के कारण हो सकते हैं।
जबकि एटियलजि कारणों को परिभाषित करता है, रोगजनन इसके परिणामों का अध्ययन करता है।
इसलिए चिकित्सा ग्रंथों को पढ़ने में हम इस तरह से आ सकते हैं जैसे: माइक्रोबियल रोगजनन, भड़काऊ रोगजनन, वायरल रोगजनन, घातक रोगजनन (बीमारी की प्रवृत्ति, आमतौर पर ट्यूमर, उत्तरोत्तर घातक होने तक खराब हो जाती है)। कई बीमारियां अलग-अलग कारण कारकों (बहुक्रियाशील एटियलजि) को पहचानती हैं और इससे भी अधिक कई अलग-अलग विकास तंत्र (मल्टीपल पैथोजेनिक) की विशेषता होती हैं।
