इबोला वायरस की उत्पत्ति ज्ञात नहीं है, लेकिन उपलब्ध सबूतों के आधार पर, फलों के बल्ले को रोगज़नक़ का प्राकृतिक जलाशय माना जाता है।
फल चमगादड़, बेहतर उड़ान लोमड़ियों के रूप में जाना जाता है, बड़े चमगादड़ हैं जो नदी के जंगलों में निवास करते हैं । स्वस्थ वायरस-असर वाले चमगादड़ की कम से कम तीन प्रजातियां ज्ञात हैं (इस जानवर में इबोला कोई लक्षण नहीं पैदा करता है): हथौड़े की अध्यक्षता वाला बल्ला (हाइपसिग्नाथस मोनस्ट्रोसस), फ्रैंकेट के कंधे पैड (एपोमेन फ्रैंकी) से फलों का बल्ला और फल का बल्ला कॉलर से (Myonycteris torquata)।
लेकिन जानवरों से इंसानों में संक्रमण कैसे हुआ? अफ्रीका की आबादी के लिए, वर्षों से चले आ रहे गृह युद्धों में चमगादड़ पोषण का स्रोत हैं। इतना ही नहीं। वनों की कटाई के लिए पश्चिमी और चीनी कंपनियां जंगल में घुस गईं और खनिजों की खोज ने " बुश-मीट " अर्थात जंगली जानवरों से प्राप्त मांस के व्यापार और खपत को बढ़ा दिया है। इसलिए, चमगादड़ ( मध्यवर्ती मेजबान ) द्वारा संक्रमित मृग या चिंपांजी खाने से इबोला वायरस का संक्रमण हो सकता है और संक्रमण फैल सकता है।
