बोटुलिज़्म का निदान प्रयोगशाला में क्लोस्ट्रीडियम बोटुलिनम विष की पहचान और नैदानिक लक्षणों के अवलोकन पर आधारित है, भले ही कभी-कभी वे गैर-विशिष्ट हों। वास्तव में, बीमारी को गुइलेन-बैर सिंड्रोम, पोलियो, स्ट्रोक, मायस्थेनिया ग्रेविस और टिक पक्षाघात के साथ भ्रमित किया जा सकता है।
खाद्य बोटुलिज़्म में, न्यूरोमस्कुलर विकारों की तस्वीर और संभावित दूषित खाद्य पदार्थों का अंतर्ग्रहण महत्वपूर्ण सुराग हैं। कम से कम 2 रोगियों में एक साथ भोजन करना जो एक ही भोजन खाते हैं, निदान को सरल करता है। रोगी के संदिग्ध भोजन या मल के नमूनों की संस्कृति और भोजन या जैविक सामग्री (जैसे रक्त, गैस्ट्रिक रस और उल्टी) में बोटुलिनम विष की पहचान के साथ सूक्ष्म जीव को अलग करके पुष्टि प्राप्त की जाती है।
दूसरी ओर, घाव बोटुलिज़्म में, सीरम टॉक्सिन की खोज या क्लोस्ट्रीडियम बोटुलिनम को त्वचा के घाव से एक नमूने से अलग करने से निदान की पुष्टि होती है।
